به گزارش شهدای ایران به نقل از میزان، روز چهاردهم خرداد سال 1368، فردای رحلت جانگداز امام خمینی، مجلس خبرگان برای تعیین تکلیف رهبری تشكيل جلسه داد؛ پس از قرائت وصيتنامه امام خمينى توسط حضرت آيت‌الله خامنه‌اى كه دو ساعت و نيم طول كشيد، بحث و تبادل نظر براى تعيين جانشينى امام خمينى و رهبر انقلاب اسلامى آغاز شد و پس از چندين ساعت سرانجام حضرت آيت‌الله خامنه‌اى ( رئيس جمهور وقت ) كه خود از شاگردان امام خمينى سلام الله عليه و از چهره هاى درخشان انقلاب اسلامى و از ياوران قيام 15 خرداد بود و در تمام دوران نهضت امام در همه فراز و نشيب‌ها در جمع ديگر ياوران انقلاب جانبازى كرده بود، به اتفاق آرا براى اين رسالت خطير برگزيده شد.

 
خانم زهرا مصطفوى، دختر گرامى حضرت امام(ره)مى‌گوید:«من مدت‏ها قبل از بركنارى قائم مقام رهبرى، شخصاً از محضر امام درباره رهبرى پرسيدم و ايشان از آيت‌اللّه خامنه‏‌اى نام بردند و پرسيدم كه آيا شرط مرجعيت و اعلميت، در رهبرى لازم نيست؟ ايشان نفى كردند. از مراتب علمى ايشان پرسيدم. صريحاً فرمودند كه «ايشان اجتهادى را كه براى ولى فقيه لازم است، دارد».