آيت ا... 'ناصر مکارم شيرازي' از مراجع تقليد در اين ديدارگفت: غربي‌ها در حال سمپاشي در دانشگاه‌هاي‌ ما هستند و ما بايد دانشگاه‌هايمان را بيمه کنيم. به گزارش ايرنا وي با اشاره به اهميت دانشگاه گفت: نخستين اهميت، اين است که مديران ما از دانشگاه مي‌آيند و به همين دليل بايد از نظر تعهد و اخلاق و ديانت در اين محيط آموزش ببينند. وي افزود: از منظر دوم بايد گفت که دشمنان قصد تاثيرگذاري بر جامعه از طريق دانشگاه را دارند و غير از خدماتي که دانشگاه به جامعه مي‌دهد، ممکن است آسيب‌هاي‌ دشمن از طريق دانشگاه به کل جامعه سرايت کند و از اين روست که علما و بزرگان حساسيت خاص روي اين مرکز علمي کشور دارند. اين مرجع تقليد افزود: اگر چند مرتبه وزير علوم به مجلس آورده شد و مجلسيان وي را قبول نکردند، نبايد اين مسئله را بر خط و خطوط خاص حمل کرد، زيرا مطمئنا اين حساسيت‌هاي‌ مهم باعث چنين اوضاعي در بحث راي اعتماد شد. وي به بومي گزيني در دانشگاه‌ها توصيه کرد و افزود: دختران به شهرهاي نزديک يا شهر خودشان منتقل شوند و اين سبب رفع نگراني خانواده‌ها مي‌شود.

به گزارش ايسنا آيت ا... موسوي اردبيلي نيز گفت: امروز دانشگاه آزاد اسلامي به قطب مهم علمي کشور و منطقه تبديل شده است، اميدوارم که اين دانشگاه بتواند در جهان به خدمات خود ادامه دهد.وي ادامه داد: دانشگاه آزاد برکتي است براي ايران و اميدوارم که اين دانشگاه بتواند در جهان به خدمات خود ادامه دهد. اين مرجع تقليد گفت:  من هميشه دعاگوي شما دست اندرکاران اين دانشگاه به خصوص جناب آقاي هاشمي رفسنجاني هستم.

آيت ا... نوري همداني نيز با بيان اين که «امروز جوامع غربي به دليل دوري از دين و اخلاق با مشکلات عديده‌اي روبه رو هستند» گفت: مجد و عظمت دين را به وسيله دانشگاه‌ها بايد در جوامع نهادينه کرد. وي يکي از توطئه‌هاي دشمن را سکولار کردن علم خواند و گفت: ما چيزي که سکولار باشد نداريم همه چيز ما با خدا، معنويات و اخلاق توأم است. وي با اشاره به نقش امام راحل، رهبر معظم انقلاب و هاشمي رفسنجاني در تأسيس دانشگاه آزاد، بيان کرد: نقش آفريني اين بزرگان در دانشگاه آزاد، يکي از مزيت‌هاي اين مجموعه است و تأسيس اين نهاد از سوي افرادي با نيت پاک و شايسته اهميت ويژه‌اي دارد.

آيت‌ا... عبدا... جوادي‌آملي نيز در ديدار با رئيس دانشگاه آزاد اسلامي اظهار کرد: شما بايد واقعا اسلامي رفتار کنيد زيرا پسوند اسلامي روي دانشگاهتان است و امام راحل هم آن را تاييد کرده است. به گزارش فارس، وي افزود: بايد بدانيم که صرف ساختن نمازخانه يا پسوند اسلامي بر سر دانشگاه، آن را اسلامي نمي‌کند ديگر اينکه اگر علم اسلامي باشد دانشگاه اسلامي خواهد شد. استاد حوزه علميه قم با بيان اينکه تفکيک جنسيتي نمي‌تواند به تنهايي دانشگاه‌ها را اسلامي کند، خاطرنشان کرد: اگر دانش اسلامي در دانشگاه‌ها تدريس شود آن گاه مي‌توانيم به دانشگاه اسلامي هم دست يابيم. آيت‌ا... جوادي آملي افزود: دو جنگ جهاني ميليون‌ها کشته بر جاي گذاشتند و امروز کساني شعار دموکراسي سر مي‌دهند که از آدم‌کشي‌هاي گذشته خود خسته شده‌اند و حال هم دست‌هايشان روي ماشه بمب‌هاي اتمي است.

مدير حوزه‌هاي علميه سراسر کشور، با تاکيد بر اين که «در اين حوزه نبايد شعارزده شد» گفت: وحدت در هدف، تعالي و بالندگي کشور، از معاني وحدت حوزه و دانشگاه است. به گزارش ايسنا،آيت ا... سيدهاشم حسيني بوشهري افزود: حوزه و دانشگاه دو بال اين کشور هستند و هرکدام براي پيشرفت، به ديگري نياز دارند. وي با اشاره به اين که «بايد دانشگاهيان را از گزند سيل گسترده شبهات حفظ کرد» ادامه داد: در شرايط حساس کنوني کشور که دشمنان توطئه‌هاي مختلفي را عليه ما طراحي مي‌کنند بايد به مسائل فرهنگي و اخلاقي در محيط‌هاي دانشگاهي توجه بيشتري کرد. مدير حوزه‌هاي علميه آزمون‌هاي آسان براي ورود به دانشگاه‌هاي دنيا و شوراي فارغ التحصيلي در آنها را مورد توجه ويژه قرار داد و گفت: اين مسئله در ايران اسلامي برعکس است و بايد در اين خصوص تجديدنظر شود.

آيت ا... « لطف ا... صافي گلپايگاني» از مراجع تقليد نيز گفت: فلسفه اصلي و اولي دانشگاه آزاد اسلامي اين بود که از نظر علمي و اخلاقي نسبت به ديگر دانشگاه‌ها سرآمد باشد و بتواند خلاء علمي و مذهبي را که قبل از انقلاب در دانشگاه بود پر کند. به گزارش ايرنا وي با اشاره به هدف بزرگاني که اين نيّت خير را داشته‌اند اظهارداشت: کساني که از اول اين دانشگاه را تاسيس کردند، مانند جناب آقاي رفسنجاني، غرض اصلي ايشان، اين بود که از نظر علمي نسبت به دانشگاه‌هاي‌ کشورهاي ديگر نمونه باشيم و محتاج بيگانگان نشويم و اقتدار علمي و اخلاقي را هميشه منظور داشتند، مخصوصا مطالب اخلاقي و مذهبي بايد در اين دانشگاه هميشه منظور مسئولان دانشگاه باشد و ما غير از اين انتظاري نداريم.

به گزارش فارس،آيت‌ا... جعفر سبحاني نيز در جمع رئيس و مديران دانشگاه آزاد اسلامي با اشاره به حل مشکل ورود به دانشگاه تا حد زياد توسط دانشگاه آزاد اسلامي خاطرنشان کرد: البته تذکراتي هم لازم است؛ نخست اينکه اگر شعبه‌هاي دانشگاه آزاد در هر شهري، بومي‌هاي آن مناطق را بپذيرند هم هزينه کمتري به دانشجويان تحميل مي‌شود و هم فرهنگ آن شهر صدمه نمي‌بيند. استاد حوزه علميه قم عنوان کرد: گاهي تداخل فرهنگي موجب تنش‌هايي مي‌شود که پذيرش بومي مي‌تواند از اين امر جلوگيري کند. وي با بيان اينکه علوم انساني در ايران هنوز پيشرفت لازم را از نظر محتوا نداشته است ،گفت: هنوز علوم انساني ما به صورت صد در صد اسلامي نيست؛ فرضيه‌هاي غربي‌ها نبايد الگوي ما قرار گيرد و به تمام معنا از آنها پيروي کنيم. اين مرجع تقليد اضافه کرد: غربي‌ها نظريه‌هاي متعددي در باره پيدايش دين دارند که نمي‌توان همه آنها را پذيرفت. وي با تاکيد بر اينکه بايد به تدريج و با کمک حوزه‌هاي علميه، علوم انساني اسلامي در دانشگاه‌ها تدريس شود گفت: مراد از اسلامي بودن علوم انساني، آن است که محتوا منطبق بر علوم وحياني باشند.

به گزارش شفقنا ،حجت الاسلام والمسلمين سيدجواد شهرستاني نماينده تام‌الاختيار آيت‌ا... العظمي سيستاني نيز در ديدار ميرزاده، دانشگاه آزاد اسلامي را يکي از بهترين دانشگاه‌هاي دنيا دانست و اظهار داشت: وضعيت فعلي اين دانشگاه تا حد زيادي مرهون تلاش‌هاي هاشمي رفسنجاني است. شهرستاني عنوان کرد: در شرايطي که دشمنان اسلام در حوزه‌هاي مختلف سياسي و فرهنگي عليه ما بسيج شده‌اند بايد به شناسايي و رفع نقاط ضعف و تقويت نقاط قوت خود بپردازيم و حتي از نقاط قوت دشمنان براي پيشبرد اهداف خود الگو بگيريم. وي ادامه داد: متاسفانه جامعه ما امروز بيشتر درگير حاشيه است.

به گزارش ايلنا نيز حميد ميرزاده و جمعي از معاونان وي روز پنجشنبه به ديدار آيت ا... حسين وحيد خراساني از مراجع تقليد شيعه در قم رفتند که البته اين ديدار به صورت خصوصي و بدون حضور خبرنگاران برگزار شد.